About us

Together with other disciplines, basic plant research faces the challenge of establishing a research data management system which meets both the needs of the community and allows the collection, processing, exchange and archiving of research datasets based on FAIR principles. Focused on this goal, the work of the DataPLANT Consortium is organized in four task areas. In Task Area I, topics such as data quality, interoperability, and standardization are pursued. In a first step, widely used ontologies and their application will be supported. Furthermore, the completion of these ontologies by adding new terms should be as smooth as possible for the user.

Task Area II (Infrastructure, Software and Service) will provide the infrastructural basis for the developed tools. The DataPLANT hub will serve as a central access point. The personnel support of the researchers is ensured by data stewards, whose training, as well as the coordination of the community contact, falls into the scope of Task Area III. Finally, Task Area IV is responsible for the communication within the project, as well as the integration into the overall NFDI and the promotion of joint efforts.   

Goals

DataPLANT works in a data-centric way and builds on existing structures. A central element towards achieving the goal is the Annotated Research Context (ARC), which acts as an entry point and will define the future structure of a data publication in the field. The ARC will cover the entire research cycle, from the experiment through the computational aspects to the actual data and metadata, as well as the resulting publications. It is based on existing formats, terminologies, and guidelines allowing integration of available data into existing repositories to be as seamless as possible. A number of tools and services are already available to ensure a quick start to improved data management from the earliest stages. At the same time, the technical infrastructure for sharing and versioning ARCs is being built. Accordingly, DataPLANT represents the central point of contact in RDM aspects for researchers in the field of basic plant research.

Task Area

Dr. Dirk von Suchodoletz

Speaker of the consortium

(Co-)applicant institutions and (co-)speakers:
  • Professor Dr. Björn Usadel – Jülich Research Centre
  • Dr. Jens Krüger – University of Tübingen
  • Juniorprofessor Dr. Timo Mühlhaus – University of Kaiserslautern

University of Freiburg

Applicant institution

Participating Institutions
  • Prof. Dr. Rolf Backofen – Bioinformatik, Albert-Ludwigs Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
  • Dr. Olaf Brandt – Leiter der IT-Abteilung, Universitätsbibliothek, Eberhard Karls Universität Tübingen
  • Prof. Dr. Andrea Bräutigam – Computational Biology, Universität Bielefeld 
  • Prof. Dr. Stefan Deßloch – Heterogene Informationssysteme Technische Universität Kaiserslautern
  • Dr. Marianne Dörr – Universitätsbibliothek Eberhard Karls Universität Tübingen
  • Prof. Dr. Alisdair Fernie – Zentraler Metabolismus Max-Planck-Institut für molekulare Pflanzenphysiologie
  • Prof. Dr. Christoph Garth – Wissenschaftliche Visualisierung Technische Universität Kaiserslautern
  • Dr. Björn Grüning – Bioinformatik Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
  • Dr. Petra Hätscher – Universitätsbibliothek Universität Konstanz
  • Prof. Dr. Eric Kemen – Zentrum für Molekularbiologie der Pflanzen (ZMBP) Eberhard-Karls-Universität Tübingen
  • Prof. Dr. Dr. hc. Edda Klipp – Theoretische Biophysik Humboldt-Universität zu Berlin
  • Prof. Dr. Ute Krämer – Molekulargenetik und Physiologie der Pflanzen Ruhr-Universität Bochum
  • Dr. Daniel Lang – Genomik und Systembiologie pflanzlicher Genome  Adresse Helmholtz Zentrum München – Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt
  • Prof. Dr. Dario – LeisterBiozentrum der LMU München Ludwig-Maximilians-Universität München (LMU) 
  • Prof. Dr. Heike Leitte – Visuelle Informationsananalyse Technische Universität Kaiserslautern
  • Prof. Dr. Klaus F.X. Mayer – Genomik und Systembiologie pflanzlicher Genome (PGSB) Helmholtz Zentrum München – Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt
  • Dr. Sven Nahnsen – Zentrum für Quantitative Biologie Eberhard Karls Universität Tübingen
  • Dr. Anja Oberländer – Leiterin Kommunikations-, Informations-, Medienzentrum (KIM) Universität Konstanz
  • Dr. Klaus Rechert – Longterm access Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
  • Prof. Dr. Ralf Reski – Pflanzenbiotechnologie Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
  • Dr. Inga Scheler – Regionales Hochschulrechenzentrum Kaiserslautern, Technische Universität Kaiserslautern
  • Prof. Dr. Karl Schmid – Pflanzenzüchtung, Saatgutforschung und Populationsgenetik Universität Hohenheim
  • Jun. Prof. Dr. Sandra Schmöckel – Physiologie der Ertragsstabilität Universität Hohenheim
  • Prof. Dr. Gerhard Schneider – Prorektor Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
  • Prof. Dr. Waltraud Schulze – Systembiologie der Pflanze Universität Hohenheim
  • Prof. Dr. Thomas Walter – Rechenzentrum Eberhard Karls Universität Tübingen
  • Prof. Dr. Andreas P.M. Weber – Biochemie der Pflanzen Heinrich Heine Universität Düsseldorf

Dr. Dirk Suchodoletz

Speaker of the consortium

University of FreiburgFreiburg

Applicant institution

(Co-)applicant institutions and (co-)speakers:
  • Professor Dr. Björn Usadel – Jülich Research Centre
  • Dr. Jens Krüger – University of Tübingen
  • Juniorprofessor Dr. Timo Mühlhaus – University of Kaiserslautern
Participating Institutions
  • Prof. Dr. Rolf Backofen – Bioinformatik, Albert-Ludwigs Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
  • Dr. Olaf Brandt – Leiter der IT-Abteilung, Universitätsbibliothek, Eberhard Karls Universität Tübingen
  • Prof. Dr. Andrea Bräutigam – Computational Biology, Universität Bielefeld 
  • Prof. Dr. Stefan Deßloch – Heterogene Informationssysteme Technische Universität Kaiserslautern
  • Dr. Marianne Dörr – Universitätsbibliothek Eberhard Karls Universität Tübingen
  • Prof. Dr. Alisdair Fernie – Zentraler Metabolismus Max-Planck-Institut für molekulare Pflanzenphysiologie
  • Prof. Dr. Christoph Garth – Wissenschaftliche Visualisierung Technische Universität Kaiserslautern
  • Dr. Björn Grüning – Bioinformatik Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
  • Dr. Petra Hätscher – Universitätsbibliothek Universität Konstanz
  • Prof. Dr. Eric Kemen – Zentrum für Molekularbiologie der Pflanzen (ZMBP) Eberhard-Karls-Universität Tübingen
  • Prof. Dr. Dr. hc. Edda Klipp – Theoretische Biophysik Humboldt-Universität zu Berlin
  • Prof. Dr. Ute Krämer – Molekulargenetik und Physiologie der Pflanzen Ruhr-Universität Bochum
  • Dr. Daniel Lang – Genomik und Systembiologie pflanzlicher Genome  Adresse Helmholtz Zentrum München – Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt
  • Prof. Dr. Dario – LeisterBiozentrum der LMU München Ludwig-Maximilians-Universität München (LMU) 
  • Prof. Dr. Heike Leitte – Visuelle Informationsananalyse Technische Universität Kaiserslautern
  • Prof. Dr. Klaus F.X. Mayer – Genomik und Systembiologie pflanzlicher Genome (PGSB) Helmholtz Zentrum München – Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt
  • Dr. Sven Nahnsen – Zentrum für Quantitative Biologie Eberhard Karls Universität Tübingen
  • Dr. Anja Oberländer – Leiterin Kommunikations-, Informations-, Medienzentrum (KIM) Universität Konstanz
  • Dr. Klaus Rechert – Longterm access Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
  • Prof. Dr. Ralf Reski – Pflanzenbiotechnologie Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
  • Dr. Inga Scheler – Regionales Hochschulrechenzentrum Kaiserslautern, Technische Universität Kaiserslautern
  • Prof. Dr. Karl Schmid – Pflanzenzüchtung, Saatgutforschung und Populationsgenetik Universität Hohenheim
  • Jun. Prof. Dr. Sandra Schmöckel – Physiologie der Ertragsstabilität Universität Hohenheim
  • Prof. Dr. Gerhard Schneider – Prorektor Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
  • Prof. Dr. Waltraud Schulze – Systembiologie der Pflanze Universität Hohenheim
  • Prof. Dr. Thomas Walter – Rechenzentrum Eberhard Karls Universität Tübingen
  • Prof. Dr. Andreas P.M. Weber – Biochemie der Pflanzen Heinrich Heine Universität Düsseldorf