Über uns
Die Pflanzenforschung nutzt interdisziplinäre Ansätze, um die Mechanismen von Physiologie, Wachstum und Ertrag von Pflanzen zu verstehen. Dabei kommen Hochdurchsatz- und gezielte Methoden zum Einsatz, die große Datenmengen aus Genomik, Transkriptomik, Proteomik und Metabolomik sowie zunehmend komplexe Bilddaten und Modellsimulationen erzeugen. Um diese Daten effektiv zu nutzen, sind ein Forschungsdatenmanagement (FDM) gemäß den FAIR-Prinzipien, der Datenaustausch und wissenschaftliche Zusammenarbeit entscheidend. DataPLANT unterstützt die Pflanzenforschung durch ein offenes Modell, das robuste und zugängliche FDM-Praktiken und Tools bereitstellt. Ein zentrales Element ist der Annotated Research Context (ARC), der relevante Forschungs- und Metadaten in FAIR-konforme digitale Objekte integriert. Zudem wird über die PLANTdataHUB Cloud-Plattform der Datenaustausch, die Veröffentlichung und die kollaborative Datenverwaltung erleichtert.
DataPLANT befindet sich in seiner zweiten Förderperiode (Oktober 2025 – September 2030). In dieser Ausbauphase wird die Verbreitung der in der ersten Förderperiode aufgebauten Tools und Dienste ausgeweitet und ihre Verankerung in der nationalen Forschungsinfrastruktur vorangetrieben.
DataPLANT fördert die Pflanzenforschungsdaten-Community durch Schulungsaktivitäten und die Bereitstellung eines Datenmanagementplan-Assistenten sowie durch die automatisierte Erfassung von Leistungskennzahlen mit Scorpion. Ziel ist eine breite, überregionale Beteiligung in ganz Deutschland innerhalb der NFDI, wobei die Interoperabilität und die Integration bestehender Datenbestände im Fokus stehen. Zudem arbeitet DataPLANT mit anderen NFDI-Konsortien zusammen — insbesondere über die BioData Interest Group (gemeinsam mit FAIRagro, NFDI4Biodiversity, NFDI4BIOIMAGE, NFDI4Microbiota und NFDI4Objects) sowie durch die Abstimmung mit den Basisdiensten von Base4NFDI (etwa IAM, PID und Terminologiedienste) —, um einheitliche Standards, gemeinsame Helpdesks und bewährte Verfahren für die Datenverarbeitung und Qualitätskontrolle zu entwickeln. Durch Automatisierung und Community-Einbindung wird die Nachhaltigkeit der DataPLANT-Dienste gesichert und die Erstellung qualitativ hochwertiger Datenpublikationen unterstützt.
Ziele
DataPLANT arbeitet datenzentriert und baut auf bestehenden Strukturen auf. Ein grundlegendes Element zur Zielerreichung ist der Annotated Research Context (ARC), welcher als Einstiegspunkt fungiert und die Struktur einer Datenpublikation in Übereinstimmung mit internationalen Standards wie RO-Crate und ISA-Tab definiert. Der ARC deckt den gesamten Forschungszyklus ab, vom Experiment über die rechnerischen Aspekte bis hin zu den eigentlichen Daten und Metadaten sowie die daraus resultierenden Publikationen. Er basiert auf bestehenden Formaten, Terminologien und Richtlinien — unter Nutzung auf die Community zugeschnittener Checklisten wie MIAPPE über das Annotationswerkzeug Swate —, sodass die Integration bestehender Daten in bereits existierende Repositorien möglichst reibungslos erfolgen kann. Es steht eine Reihe ausgereifter Tools und Services zur Verfügung, um von Beginn an einen schnellen Einstieg in ein verbessertes Datenmanagement zu gewährleisten. Gleichzeitig ist die technische Infrastruktur für die gemeinsame Nutzung, Versionierung und automatisierte Broker-Einreichung (über MARS) von ARCs im PLANTdataHUB vollständig in Betrieb. Dementsprechend stellt DataPLANT in FDM-Belangen die zentrale Anlaufstelle für Forschende im Bereich der Pflanzen-Grundlagenforschung dar.
Aufgabenbereich
Dr. Dirk von Suchodoletz
Sprecher des Konsortiums
(Mit-)Antragstellende Institutionen und (Co-)Sprecher:innen:
- Prof. Dr. Timo Mühlhaus – Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Dr. Uwe Scholz – Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK)
- Prof. Dr. Björn Usadel – Forschungszentrum Jülich
Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
Antragsstellende Institution
Beteiligte Institutionen
- Prof. Dr. Rolf Backofen – Bioinformatik, Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
- Olaf Brandt – Leiter der IT-Abteilung, Universitätsbibliothek, Eberhard Karls Universität Tübingen
- Prof. Dr. Andrea Bräutigam – Computational Biology, Universität Bielefeld
- Dr. Dominik Brilhaus – CEPLAS Cluster of Excellence on Plant Sciences Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf
- Dr. Magdalene Cyra – fdm.nrw, University Library, University of Duisburg-Essen
- Prof. Dr. Stefan Deßloch – Heterogene Informationssysteme, Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Dr. Barbara Ebert – Executive Secretary, Gesellschaft für Biologische Daten, GFBio e.V. Bremen
- Prof. Dr. Alisdair Fernie – Zentraler Metabolismus Max-Planck-Institut für molekulare Pflanzenphysiologie
- Prof. Dr. Christoph Garth – Wissenschaftliche Visualisierung, Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Dr. Björn Grüning – Bioinformatik Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
- Prof. Dr. Eric Kemen – Interfaculty Institute of Microbiology and Infection Medicine & Center for Plant Molecular Biology, Eberhard Karls University Tübingen
- Oliver Kohl-Frey – Kommunikations-, Informations-, Medienzentrum (KIM) Universität Konstanz
- Prof. Dr. Maria von Korff Schmising – Heinrich-Heine-University Düsseldorf, Plant Genetics
- Prof. Dr. Ute Krämer – Molekulargenetik und Physiologie der Pflanzen Ruhr-Universität Bochum
- Dr. Jens Krüger – High Performance and Cloud Computing Group, IT Center, Eberhard Karls University Tübingen
- Matthias Landwehr – Kommunikations-, Informations-, Medienzentrum (KIM) Universität Konstanz
- Prof. Dr. Dario Leister – Biozentrum, Ludwig-Maximilians-Universität München (LMU)
- Prof. Dr. Heike Leitte – Visuelle Informationsanalyse, Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Prof. Dr. Michael Lenhard – Genetics, University of Potsdam
- Prof. Dr. Rosa Lozano-Durán – Center for Plant Molecular Biology, Eberhard Karls University Tübingen
- Prof. Dr. Klaus F.X. Mayer – Genomik und Systembiologie pflanzlicher Genome (PGSB) Helmholtz Zentrum München – Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt
- Prof. Dr. Isabel Monte – Center for Plant Molecular Biology, Eberhard Karls University Tübingen
- PD Dr. Wolfgang Müller – HITS gGmbH, Scientific Databases and Visualization Group (SDBV)
- Prof. Dr. Thomas Nägele – Plant Evolutionary Cell Biology, Ludwig-Maximilians University of München
- Prof. Dr. Sven Nahnsen – Zentrum für Quantitative Biologie Eberhard Karls Universität Tübingen
- Prof. Dr. Marcel Quint – Institute of Agricultural and Nutritional Science, Martin Luther University Halle-Wittenberg
- Prof. Dr. Klaus Rechert – Verwaltungs- und Wirtschaftsinformatik Hochschule für öffentliche Verwaltung Kehl
- Prof. Dr. Ralf Reski – Pflanzenbiotechnologie Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
- Prof. Dr. Andreas Richter – Plant metabolic Physiology, University of Rostock
- Dr. Inga Scheler – Regionales Hochschulrechenzentrum Kaiserslautern, Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Prof. Dr. Christian Schmitz-Linneweber – Molecular Genetics, Humboldt University of Berlin
- Prof. Dr. Waltraud Schulze – Systembiologie der Pflanze Universität Hohenheim
- Prof. Dr. Nadine Töpfer – Institute for Plant Sciences, University of Cologne
- Prof. Dr. Haim Treves – Plant Metabolism, University of Kaiserslautern-Landau
- Prof. Dr. Jan de Vries – Applied Bioinformatics, Georg-August University of Göttingen
- Prof. Dr. Thomas Walter – Rechenzentrum Eberhard Karls Universität Tübingen
- Prof. Dr. Andreas P.M. Weber – Biochemie der Pflanzen Heinrich Heine Universität Düsseldorf
- Prof. Dr. Stefanie Weidtkamp-Peters – Center for Advanced Imaging Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf
- Prof. Dr. Felix Willmund – Molecular Plant Physiology, Philipps-University of Marburg
Dr. Dirk von Suchodoletz
Sprecher des Konsortiums
Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
Antragsstellende Institution
(Mit-)Antragstellende Institutionen und (Co-)Sprecher:innen:
- Prof. Dr. Timo Mühlhaus – Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Dr. Uwe Scholz – Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Kulturpflanzenforschung (IPK)
- Prof. Dr. Björn Usadel – Forschungszentrum Jülich
Beteiligte Institutionen
- Prof. Dr. Rolf Backofen – Bioinformatik, Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
- Olaf Brandt – Leiter der IT-Abteilung, Universitätsbibliothek, Eberhard Karls Universität Tübingen
- Prof. Dr. Andrea Bräutigam – Computational Biology, Universität Bielefeld
- Dr. Dominik Brilhaus – CEPLAS Cluster of Excellence on Plant Sciences Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf
- Dr. Magdalene Cyra – fdm.nrw, University Library, University of Duisburg-Essen
- Prof. Dr. Stefan Deßloch – Heterogene Informationssysteme, Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Dr. Barbara Ebert – Executive Secretary, Gesellschaft für Biologische Daten, GFBio e.V. Bremen
- Prof. Dr. Alisdair Fernie – Zentraler Metabolismus Max-Planck-Institut für molekulare Pflanzenphysiologie
- Prof. Dr. Christoph Garth – Wissenschaftliche Visualisierung, Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Dr. Björn Grüning – Bioinformatik Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
- Prof. Dr. Eric Kemen – Interfaculty Institute of Microbiology and Infection Medicine & Center for Plant Molecular Biology, Eberhard Karls University Tübingen
- Oliver Kohl-Frey – Kommunikations-, Informations-, Medienzentrum (KIM) Universität Konstanz
- Prof. Dr. Maria von Korff Schmising – Heinrich-Heine-University Düsseldorf, Plant Genetics
- Prof. Dr. Ute Krämer – Molekulargenetik und Physiologie der Pflanzen Ruhr-Universität Bochum
- Dr. Jens Krüger – High Performance and Cloud Computing Group, IT Center, Eberhard Karls University Tübingen
- Matthias Landwehr – Kommunikations-, Informations-, Medienzentrum (KIM) Universität Konstanz
- Prof. Dr. Dario Leister – Biozentrum, Ludwig-Maximilians-Universität München (LMU)
- Prof. Dr. Heike Leitte – Visuelle Informationsanalyse, Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Prof. Dr. Michael Lenhard – Genetics, University of Potsdam
- Prof. Dr. Rosa Lozano-Durán – Center for Plant Molecular Biology, Eberhard Karls University Tübingen
- Prof. Dr. Klaus F.X. Mayer – Genomik und Systembiologie pflanzlicher Genome (PGSB) Helmholtz Zentrum München – Deutsches Forschungszentrum für Gesundheit und Umwelt
- Prof. Dr. Isabel Monte – Center for Plant Molecular Biology, Eberhard Karls University Tübingen
- PD Dr. Wolfgang Müller – HITS gGmbH, Scientific Databases and Visualization Group (SDBV)
- Prof. Dr. Thomas Nägele – Plant Evolutionary Cell Biology, Ludwig-Maximilians University of München
- Prof. Dr. Sven Nahnsen – Zentrum für Quantitative Biologie Eberhard Karls Universität Tübingen
- Prof. Dr. Marcel Quint – Institute of Agricultural and Nutritional Science, Martin Luther University Halle-Wittenberg
- Prof. Dr. Klaus Rechert – Verwaltungs- und Wirtschaftsinformatik Hochschule für öffentliche Verwaltung Kehl
- Prof. Dr. Ralf Reski – Pflanzenbiotechnologie Albert-Ludwigs-Universität Freiburg
- Prof. Dr. Andreas Richter – Plant metabolic Physiology, University of Rostock
- Dr. Inga Scheler – Regionales Hochschulrechenzentrum Kaiserslautern, Rheinland-Pfälzische Technische Universität Kaiserslautern-Landau
- Prof. Dr. Christian Schmitz-Linneweber – Molecular Genetics, Humboldt University of Berlin
- Prof. Dr. Waltraud Schulze – Systembiologie der Pflanze Universität Hohenheim
- Prof. Dr. Nadine Töpfer – Institute for Plant Sciences, University of Cologne
- Prof. Dr. Haim Treves – Plant Metabolism, University of Kaiserslautern-Landau
- Prof. Dr. Jan de Vries – Applied Bioinformatics, Georg-August University of Göttingen
- Prof. Dr. Thomas Walter – Rechenzentrum Eberhard Karls Universität Tübingen
- Prof. Dr. Andreas P.M. Weber – Biochemie der Pflanzen Heinrich Heine Universität Düsseldorf
- Prof. Dr. Stefanie Weidtkamp-Peters – Center for Advanced Imaging Heinrich-Heine-Universität Düsseldorf
- Prof. Dr. Felix Willmund – Molecular Plant Physiology, Philipps-University of Marburg