Bildgebende Verfahren in der Biologie, insbesondere Hochleistungsmikroskope auf der Basis von Licht- und Elektronenstrahlen, ermöglichen detaillierte Einblicke in die Prozesse des Lebens. Dabei entstehen weit mehr als Bilder: Mikroskopie erzeugt hochkomplexe Datensätze, die präzise Messungen und Analysen erlauben. Heute ist es nicht ungewöhnlich, dass Mikroskope mehrere Terabyte an Daten in wenigen Stunden produzieren. Diese Daten zu speichern, zu verarbeiten und öffentlich zugänglich zu machen, stellt eine große Herausforderung dar.
Mit NFDI4BIOIMAGE schafft die Nationale Forschungsdateninfrastruktur Voraussetzungen, um diese Hürden zu meistern. Mitglieder des Konsortiums gestalten die internationale Weiterentwicklung des offenen Standards „OME-NGFF“ maßgeblich mit. Dessen zentrale Implementierung „OME-Zarr“ ermöglicht es, große Bilddatensätze in der Cloud zu speichern und über einen Webbrowser zugänglich zu machen. Gleichzeitig bleiben komplexe Bilddaten und Metadaten vollständig erhalten. Die Daten können gestreamt und schrittweise geladen werden, ohne vollständig heruntergeladen werden zu müssen.
Die Weiterentwicklung erfolgt in internationaler Abstimmung über einen Request for Comments Prozess, der sicherstellt, dass die Bedürfnisse der wissenschaftlichen Fachgemeinschaft berücksichtigt werden. So entsteht ein internationaler Standard für biologische Bilddaten, der eine nachhaltige Grundlage für die langfristige Nutzung großer Forschungsdatensätze schafft.
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