NFDI4Microbiota treibt FAIR-Data in der Mikrobiologie voran, indem das Konsortium Community-Standards fördert und zuvor fragmentierte Datenressourcen kuratiert und integriert. Zwei zentrale Datenbanken, metaTraits und Metalog, haben Daten zu phänotypischen Merkmalen von Mikroben und Kontext-Metadaten zu Metagenomen FAIRifiziert.
Zusammen mit der Datenbank SPIRE unseres Partners EMBL, die einheitlich prozessierte Metagenome bereitstellt, haben diese umfangreichen und interoperablen Ressourcen eine globale Studie zum Fluss von Genen und insbesondere Antibiotikaresistenzen ermöglicht. Die vom EMBL geleitete Studie wurde kürzlich in der Fachzeitschrift Cell veröffentlicht. Die Arbeit zeigt, dass Mikrobiome weltweit stärker miteinander vernetzt sind als bisher angenommen.
Eine kleine Gruppe hochgradig anpassungsfähiger Mikroben, sogenannte Generalisten, kann in sehr unterschiedlichen Umgebungen überleben, vom Ozean bis zum menschlichen Darm. Der Mensch beschleunigt die Ausbreitung dieser Mikroben, indem er neue Verbindungen zwischen Lebensräumen schafft, die sonst getrennt bleiben würden. Wenn sich Generalisten zwischen den Habitaten bewegen, können sie durch horizontalen Gentransfer Gene mit anderen Mikroben austauschen.
Dieser Austausch kann verschiedenste Gene verbreiten, etwa Antibiotikaresistenzen (AMR), was die Relevanz des „One Health“-Konzepts unterstreicht. Die Studie zeigt eindrücklich, wie die Dateninfrastruktur von NFDI4Microbiota hochkarätige, globale Mikrobiom-Forschung ermöglicht. Durch die Integration und Analyse riesiger Datensätze über Ökosysteme hinweg können Forschende entschlüsseln, wie mikrobielle Gemeinschaften die Gesundheit von Mensch, Tier und Umwelt auf der ganzen Welt miteinander verbinden.
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